El Sistema de Centros CONACyT es un conjunto de 27 instituciones de investigación que cubren los principales campos del conocimiento científico, tecnológico, social y humanístico. De acuerdo a sus objetivos y especialidades, el Sistema de Centros de Investigación Conacyt se agrupa en tres grandes subsistemas: Ciencias Exactas y Naturales (10 Centros) Ciencias Sociales y Humanidades (8 Centros), Desarrollo Tecnológico y Servicios (8 Centros) y uno más especializado en el financiamiento de estudios de posgrado.

Ciencias Exactas y Naturales

CIAD
Centro de Investigación en Alimentación y Desarrollo, A.C
CIBNOR
Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S.C
CICESE
Centro de Investigación Científica y de Educación Superior de Ensenada, B.C.
CICY
Centro de Investigación Científica de Yucatán, A.C.
CIMAT
Centro de Investigación en Matemáticas, A.C.
CIMAV
Centro de Investigación en Materiales Avanzados,S.C.
CIO
Centro de Investigaciones en Óptica, A.C.
INECOL
Instituto de Ecología, A.C.
INAOE
Instituto Nacional de Astrofísica, Óptica y Electrónica
IPICYT
Instituto Potosino de Investigación Científica y Tecnológica, A.C.

Ciencias Sociales y Humanidades

CIDE
Centro de Investigación y Docencia Económicas, A.C.
CIESAS
Centro de Investigaciones y Estudios Superiores en Antropología Social
CENTRO GEO
Centro de Investigación en Geografía y Geomática “Ing. Jorge L. Tamayo” A.C.
COLEF
El Colegio de la Frontera Norte, A.C.
COLMICH
El Colegio de Michoacán, A.C.
COLSAN
El Colegio de San Luis, A.C.
ECOSUR
El Colegio de la Frontera Sur
MORA
Instituto de Investigaciones “Dr. José María Luis Mora”

Desarrollo Tecnológico y Servicios

CIATEC, A.C.
Centro de Innovación Aplicada en Tecnologías Competitivas
CIATEJ
Centro de Investigación y Asistencia en Tecnología y Diseño del Estado de Jalisco, A.C.
CIATEQ, A.C.
Centro de Tecnología Avanzada
CIDESI
Centro de Ingeniería y Desarrollo Industrial
CIDETEQ
Centro de Investigación y Desarrollo Tecnológico en Electroquímica, S.C.
CIQA
Centro de Investigaciónen Química Aplicada
COMIMSA
Corporación Mexicana de Investigación en Materiales, S.A. de C.V.
INFOTEC
Centro de Investigación e Innovación en Tecnologías de la Información y Comunicación

Financiamiento de Estudios de Posgrado

FIDERH
Fondo para el Desarrollo de Recursos Humanos